新干线超进化研究所为了从诞生于“漆黑新干线”的巨大怪物体手中守护日本的未来，　　人们开发了“新干线变形机器人SHINKALION”。　　具备与SHINKALION较高适合率的孩子们成为驾驶员，

为了从迷之巨大怪物手上守护日本的和平，新干线超进化研究所开发了「新干线变形机器人 辛卡利欧」。 为了防备新的敌人袭来，研究所还秘密开发新型机器人「辛卡利欧Z」。 与「辛卡利欧Z」适合率高的孩子们被选作